| 医療法人社団 悦伝会 目白病院 | 〒161-0033 新宿区下落合三丁目22番23号 | 03-3953-9909 | 一般 100床 | 内、外、整外、脳外、放、麻 | 現存 |
| 医療法人社団 広恵会 春山記念病院 | 〒169-0073 新宿区百人町一丁目24番5号 | 03-3363-1661 | 一般 99床 | 外、整外、脳外、形外、麻、リハ、内、消化器外科、消化器内科、ひ、救急科、美外、美容皮膚科 | 現存 |
| 医療法人社団 鉄友会 柳町病院 | 〒162-0061 新宿区市谷柳町25番地 | 03-3268-3521 | 一般 39床 | 内、外、整外、リハ、小、皮、呼内、循環器内科、消化器内科、ひ | 現存 |
| 一般社団法人 ICR 附属 クリニカルリサーチ東京病院 | 〒160-0004 新宿区四谷四丁目4番1号 四谷国際ビル5階・6階 | 03-3355-7200 | 一般 50床 | 内、臨床検査科、循環器内科、神経精神科、呼内 | 現存 |
| 慶應義塾大学病院 | 〒160-0016 新宿区信濃町35番地 | 03-3353-1211 | 一般 934床/精神 16床 | 内、小、外、整外、婦、眼、精、神内、形外、脳外、産、リハ、麻、皮、ひ、心外、呼外、小外、リウ、耳い、歯外、循環器内科、呼内、消化器内科、消化器外科、腎臓・内分泌・代謝内科、漢方内科、腫瘍内科、感染症内科、腫瘍外科、移植外科、乳腺外科、臨床検査科、内視鏡外科、頭頸部外科、救急科、血液内科、放射線治療科、放射線診断科、病理 | 現存 |
| 公益財団法人 神経研究所 附属晴和病院 | 〒162-0851 新宿区弁天町91番地 | 03-3260-9171 | 精神 104床 | 精、心内、睡眠障害精神科 | 現存 |
| 国立健康危機管理研究機構 国立国際医療センター | 〒162-0052 新宿区戸山一丁目21番1号 | 03-3202-7181 | 一般 689床/精神 6床/結核 7床/一般(感染) 4床 | 内、小、小外、外、整外、皮、ひ、麻、産、婦、リハ、脳内、心外、歯、呼、呼外、眼、耳い、精、脳外、形外、歯外、アレ、リウ、循環器内科、糖尿病内科、血液内科、内分泌代謝内科、腎臓内科、消化器内科、消化器外科、心内、感染症内科、新生児内科、内視鏡内科、緩和ケア内科、人工透析内科、ペインクリニック内科、頭頸部外科、救急科、放射線診断科、放射線治療科、病理 | 現存 |
| 社会福祉法人 聖母会 聖母病院 | 〒161-0032 新宿区中落合二丁目5番1号 | 03-3951-1111 | 一般 154床 | 内、小、放、外、皮、産婦、精、乳腺外科、消化器内視鏡内科、耳い、眼、整外、ひ、麻、病理 | 現存 |
| 地方独立行政法人 東京都立病院機構 東京都立大久保病院 | 〒160-8488 新宿区歌舞伎町二丁目44番1号 | 03-5273-7711 | 一般 304床 | 内、腎臓内科、精、外、整外、リハ、脳外、皮、ひ、婦、眼、耳い、歯外、麻、放、病理、循環器内科、血管外科、乳腺外科、消化器外科 | 現存 |
| 東京医科大学病院 | 〒160-0023 新宿区西新宿六丁目7番1号 | 03-3342-6111 | 一般 885床/精神 19床 | 内、精、神内、小、外、整外、形外、脳外、呼外、小外、皮、ひ、産、婦、眼、耳い、リハ、放、放射線診断科、放射線治療科、麻、歯外、リウ、心外、矯歯、血液内科、糖尿病内分泌内科、腎臓内科、老年内科、呼内、循環器内科、消化器内科、消化器外科、臨床検査科、乳腺外科、救急科、病理 | 現存 |
| 東京女子医科大学病院 | 〒162-0054 新宿区河田町8番1号 | 03-3353-8111 | 精神 27床 | 内、小、小児科(新生児)、腎臓小児科、循環器小児科、放、放射線診断科、放射線治療科、外、整外、脳内、小外、眼、耳い、産、婦、脳外、呼外、精、形外、心外、ひ、皮、麻、歯、矯歯、小歯、歯外、リハ、リウ、循環器内科、呼内、消化器内科、消化器外科、血液内科、内分泌内科、腎臓内科、疼痛緩和内科、人工透析内科、ペインクリニック内科、救急科、内分泌外科、病理、糖尿病・代謝内科、乳腺外科、臨床検査科 | 現存 |
| 独立行政法人 地域医療機能推進機構 東京山手メディカルセンター | 〒169-0073 新宿区百人町三丁目22番1号 | 03-3364-0251 | 一般 408床 | 内、消化器内科、消化器外科、循環器内科、呼内、外、呼外、心外、整外、形外、脳外、皮、大腸・肛門外科、ひ、産婦、小、眼、耳い、歯外、放、麻、リハ、病理、乳腺外科、血液内科、糖尿病・内分泌内科、精、腎臓内科、救急科、脳内、リウ、疼痛緩和外科 | 現存 |
| 独立行政法人 地域医療機能推進機構 東京新宿メディカルセンター | 〒162-0821 新宿区津久戸町5番地1 | 03-3269-8111 | 一般 452床 | 整外、形外、リハ、リウ、外、呼外、消化器外科、消化器内科、乳腺外科、脳外、内、循環器内科、呼内、腎臓内科、糖尿病内分泌内科、血液内科、緩和ケア内科、脳内、皮、ひ、産婦、眼、耳い、小、精、放射線科、放射線診断科、放射線治療科、歯、歯外、麻、病理、救急科 | 現存 |